Οι διαθέσιμοι πόροι πρόκειται να κατανεμηθούν για την κάλυψη των αναγκών του μέτρου σε τρεις βασικούς πυλώνες
Σύμφωνα με την κοινή απόφαση των Υπουργών Εθνικής Οικονομίας και Οικονομικών, και Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής που δημοσιεύθηκε στο ΦΕΚ 1343/2026, καθορίστηκε το ποσό για την υλοποίηση του μέτρου του Μεταφορικού Ισοδύναμου για το έτος 2025. Η συνολική δαπάνη ανέρχεται στο ποσό των ογδόντα εκατομμυρίων ευρώ (80.000.000 €). Η απόφαση αυτή αποσκοπεί στη μείωση των ενδοπεριφερειακών ανισοτήτων και στην ενίσχυση της συνοχής του πληθυσμού στα νησιά.
Το εγκεκριμένο κονδύλι πρόκειται να κατανεμηθεί στρατηγικά για την κάλυψη των αναγκών του μέτρου σε τρεις βασικές κατηγορίες: τους επιβάτες, τη διακίνηση εμπορευμάτων και το κόστος των καυσίμων. Με αυτόν τον τρόπο, το κράτος επιδιώκει να εξισώσει το κόστος μετακίνησης και μεταφοράς για τους κατοίκους και τις επιχειρήσεις των νησιωτικών περιοχών με το αντίστοιχο κόστος που ισχύει στην ηπειρωτική Ελλάδα.
Η χρηματοδότηση του μέτρου καλύπτεται από το Εθνικό Πρόγραμμα Ανάπτυξης της προγραμματικής περιόδου 2021-2025. Συγκεκριμένα, οι πόροι προέρχονται από το Τομεακό Πρόγραμμα του Υπουργείου Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής, με φορέα υλοποίησης τη Γενική Γραμματεία Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής. Η απόφαση τίθεται σε άμεση εφαρμογή από τη στιγμή της δημοσίευσής της στην Εφημερίδα της Κυβερνήσεως.