Η Κομισιόν προσφεύγει κατά της χώρας καθώς δεν όρισε Ζώνες Ειδικής Προστασίας στα θαλάσσια ύδατά της, αγνοώντας τα επιστημονικά δεδομένα για το απειλούμενο θαλασσοπούλι.
Η Ευρωπαϊκή Επιτροπή αποφάσισε να παραπέμψει τη Σλοβενία στο Δικαστήριο της Ευρωπαϊκής Ένωσης, λόγω της μη συμμόρφωσής της με την οδηγία για τα πτηνά (οδηγία 2009/147/ΕΚ). Η συγκεκριμένη οδηγία υποχρεώνει τα κράτη μέλη να ορίζουν Ζώνες Ειδικής Προστασίας (ΖΕΠ) με σκοπό τη διαφύλαξη των άγριων πτηνών. Ωστόσο, η Σλοβενία έχει αποτύχει να κατατάξει τις καταλληλότερες περιοχές των θαλάσσιων υδάτων της, και ειδικότερα την περιοχή Osrednji Tržaški zaliv, υπό το καθεστώς προστασίας που απαιτείται για τη διασφάλιση του Θαλασσοκόρακα της Μεσογείου.
Η διαδικασία επί παραβάσει μετρά ήδη αρκετά χρόνια, καθώς η Επιτροπή είχε αποστείλει στη χώρα προειδοποιητική επιστολή τον Ιούνιο του 2021 και αιτιολογημένη γνώμη τον Ιούλιο του 2022. Παρά τις συναντήσεις και τις ανταλλαγές απόψεων που ακολούθησαν, οι προσπάθειες των σλοβενικών αρχών κρίθηκαν ανεπαρκείς, καθώς οι περιοχές που ορίστηκαν υπολείπονται τόσο σε αριθμό όσο και σε μέγεθος. Η Κομισιόν βασίστηκε στα συμπεράσματα του ευρωπαϊκού έργου SIMARINE LIFE, το οποίο είχε ολοκληρωθεί από το 2015 και είχε επιβεβαιώσει επιστημονικά τις καταλληλότερες Σημαντικές Περιοχές για τα Πουλιά (ΣΠΠ) στην παράκτια ζώνη της χώρας.
Ο Μεσογειακός Θαλασσοκόρακας αποτελεί προστατευόμενο υποείδος που περιλαμβάνεται στο Παράρτημα Ι της Οδηγίας για τα Πουλιά και εξαπλώνεται αποκλειστικά στη Μεσόγειο και τη Μαύρη Θάλασσα. Η Βόρεια Αδριατική, τμήμα της οποίας βρίσκεται υπό τη δικαιοδοσία της Σλοβενίας, είναι κρίσιμης σημασίας για το συγκεκριμένο θαλασσοπούλι, καθώς εκεί συγκεντρώνεται μεγάλο μέρος του πληθυσμού του για διατροφή και προετοιμασία πριν από τη μετανάστευση. Μάλιστα, κατά την περίοδο 2006-2011, ο πληθυσμός που κούρνιαζε κατά μήκος των σλοβενικών ακτών υπολογιζόταν σε 2.000 έως 3.000 άτομα.
Οι θαλάσσιες προστατευόμενες περιοχές είναι ζωτικής σημασίας, καθώς διασφαλίζουν τις ζώνες αναπαραγωγής, διατροφής και μετανάστευσης των ειδών. Οι Ζώνες Ειδικής Προστασίας αποτελούν αναπόσπαστο κομμάτι του δικτύου Natura 2000 σε όλη την ΕΕ και συνδέονται άμεσα με τους στόχους της στρατηγικής της ΕΕ για τη βιοποικιλότητα. Το Δικαστήριο της Ευρωπαϊκής Ένωσης έχει ήδη αναγνωρίσει ότι το δίκτυο επιστημονικών αναφορών (ΣΠΠ) αποτελεί το διεθνές πρότυπο για τον χαρακτηρισμό αυτών των περιοχών, γεγονός που καθιστά τη σλοβενική ολιγωρία νομικά έκθετη.