Ταυτόχρονα, σοβαρές ανησυχίες εγείρονται και για το κόστος εφαρμογής, το οποίο φαίνεται να μετακυλίεται σε μεγάλο βαθμό στους ίδιους τους κτηνοτρόφους.
Η Επιτροπή σημειώνει επίσης ότι η προσέγγιση αυτή συνάδει με την αρχή της προφύλαξης και προβλέπει σύστημα παρακολούθησης των επιπτώσεων μετά την κυκλοφορία των προϊόντων.